Cơ cấu tổ chức của trường hiện nay bao gồm: Ban giám hiệu, 8 Phòng, 9 Khoa, 2 Tổ bộ môn trực thuộc, 02 Ban (Ban quản lý xây dựng và Ban quản trị mạng & Wedsite) và các Trung tâm.

Công đoàn trường Cao đẳng Công nghiệp Tuy Hòa trong suốt 35 năm qua luôn là người đồng hành cùng với lãnh đạo nhà trường, chia xẻ và tháo gỡ khó khăn, đồng thời tìm hướng phát triển hợp với tình hình thực tiễn, mang lại hiệu quả thiết thực.

Trải qua 37 năm, Đảng bộ trường Cao đẳng Công nghiệp Tuy Hòa đã không ngừng phấn đấu thực hiện đầy đủ chức năng, nhiệm vụ của tổ chức cơ sở Đảng trong đơn vị sự nghiệp trường Cao đẳng. Đảng bộ đã lãnh đạo toàn diện, trực tiếp mọi hoạt động của nhà trường, hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ được giao, liên tục nhiều năm Đảng bộ Trường được công nhận là Đảng bộ trong sạch, vững mạnh.